微孔濾膜及一次性微生物極限過濾器與濾頭銜接，確保微孔濾膜無缺。將事前準備好的供試液注入濾杯內，不要操過濾杯刻度。按下“power”鍵，再翻開相應的閥門，再按下“power”鍵，完結集菌過濾待供試液悉數過濾完結后，關閉相應的閥門，再按下“power”鍵，完結集菌過濾。
抽濾前，應確保管道密封性杰出。運用一次性微生物極限過濾器，翻開無菌包裝前，先查看包裝是否破損。添加供試液時的液體高度不能超過濾杯刻度。微生物極限儀隨時留意抽濾瓶狀況，液體不能吞沒進氣口。能夠依據實際狀況挑選抽濾瓶的容積。若無菌室選用化學劑消毒時，將儀器置密封罩內，或搬出無菌室，避免損壞電子部件腐蝕金屬部件。環境溫度控制在10℃～30℃。相對濕度≤80%RH無水珠凝聚現象。每次運用完畢后，儀器外表用酒精擦洗。